1、兩者的法律依據不同。從上述概念解說,我們可以知道個體工商注冊是由《個體工商戶條例》規定的;而注冊個人獨資企業則是由《個人獨資企業法》規定的;
2、注冊個人獨資企業必須要有固定的經營場所和合法的企業名稱,但個體工商注冊可以不需要名稱字號,也可以不需要固定的生產經營場所;
3、個人獨資企業可以設立分支機構,但個體工商戶不行;
4、個人獨資企業可轉讓公司,但個體工商戶只有在家庭經營的組成形式下才能變更經營者姓名,而且必須是家庭成員;
5、兩者在財務制度不同。個人獨資企業必須監理完善的財務制度,進行相應的會計核算;而個體工商戶則不做要求。