網上報稅操作流程分為以下幾步：

（第一步）填寫申報表

納稅人利用“填寫申報表”功能填寫需申報的申報表（沒有在地稅部門做過稅種登記的稅種，網上不能申報）；分主附表的，先填寫附表并保存，然后打開主表進行編輯或直接保存，如：營業稅申報。

（第二步）正式申報

納稅人利用“正式申報”功能將已填寫并保存過的申報表正式申報到地稅征管系統。申報表正式申報成功后，不能再進行填寫和修改。未正式申報或正式申報失敗的申報表，其包含的稅種按未申報對待。

（第三步）網上劃款

納稅人利用“網上劃款”功能對正式申報成功的申報表，通過劃款功能生成待劃款稅票，若提示劃款失敗，應返回繼續進行劃款操作。（地稅部門會將待劃款稅票的信息定期傳遞到銀行進行扣款）。納稅人可在成功劃款一日后通過“網上劃款”功能的實繳查詢，確認地稅部門扣款是否成功。

（第四步）申報查詢、劃款查詢

正式申報及網上劃款結束后應利用“申報查詢”、“劃款查詢”進行申報查詢、劃款查詢。確保需要申報的申報表都已經申報、劃款成功。